L’insertion du projet dans un contexte aussi contraint, tant physiquement et qu’en termes de fonctionnalités existante relève du défi technique. La principale innovation technique est avant tout le concept, développé dès les études préliminaires et qui consistait à effectuer d’une reprise en sous-œuvre généralisée des bâtiments intérieurs du CNIT pour réaliser la moitié du corps principal de la gare. Le projet comporte en fait également une multiplicité d’ouvrages dits « annexes » mais qui sont autant de projets remarquables et pour lesquels des solutions spécifiques ont dues être trouvées pour s’insérer dans un contexte existant très sensible (en particulier la coque du CNIT) en utilisant des solutions techniques spécifiques aux ouvrages d’arts, travaux souterrains et spéciaux ainsi qu’à la réhabilitation de bâtiments.